2024年9月5日，DeepMind发布了Alpha模型家族的新成员——AlphaProteo，专注于设计蛋白质结合剂，堪称“专精版”的AlphaFold。这类“蛋白质结合剂”可以加速许多领域研究的进展，包括药物开发、细胞和组织成像、疾病理解和诊断，甚至是提升作物抗虫性，将大幅减少所需的实验室工作，提升开发效率。

实验发现，AlphaProteo可以针对不同的目标蛋白设计新的蛋白结合剂，比如为癌症、糖尿病并发症相关的血管内皮生长因子A（VEGF-A）设计出成功的蛋白结合剂。在7种靶标蛋白测试中，与目前最佳方法相比，AlphaProteo的实验成功率更高，且蛋白质的结合亲和力提高了3-300倍。

AlphaProteo的训练数据包括蛋白质结构数据库（ProteinData Bank，PDB）和AlphaFold生成的1亿多个预测结构。通过训练，AlphaProteo学会了蛋白质分子相互结合的方式。只要给定目标分子的结构以及优先结合位点，AlphaProteo模型就能生成在相应位点结合的候选蛋白质。

信息来源：

https://deepmind.google/discover/blog/alphaproteo-generates-novel-proteins-for-biology-and-health-research/

https://storage.googleapis.com/deepmind-media/DeepMind.com/Blog/alphaproteo-generates-novel-proteins-for-biology-and-health-research/Protein_Design_White_Paper_2024.pdf

https://mp.weixin.qq.com/s/lFy6ZwUpb2RGmb3tl_lKXg