美国北卡罗来纳大学医学院、加州大学旧金山分校、斯坦福大学和哈佛大学的研究人员测试了AlphaFold2的预期功能，证实了AlphaFold2可有效生成蛋白质3D模型，具有预测配体结合的能力。相关研究成果于2024年5月16日发表在《科学》期刊上。

为了确定AlphaFold2预测效果的准确度，研究人员向预测软件提供了已知与受体结合化合物的信息和未知与受体结合化合物的信息，对回顾性研究结果与前瞻性研究结果进行了比较。研究人员选择了两种蛋白质sigma-2和5-HT2A，利用前瞻性和回顾性研究预测了多达16亿种候选药物。

结果显示，对于sigma-2蛋白而言，前瞻性研究的结果显示蛋白-配体相互作用中的成功率是54%，而在回顾性模型中成功激活的比例为51%；对于5-HT2A蛋白而言，前瞻性模型中蛋白-配体相互作用成功率为26%，而在回顾性模型中为23%。这些发现首次证明了AlphaFold2可成为一种有效的药物发现工具。

信息来源：

https://www.science.org/doi/10.1126/science.adn6354

https://mp.weixin.qq.com/s/hDPZwA4p8xxk0yinXNbq0g