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美橡树岭国家实验室创建从基因到生态系统的数据集

日期:2024-07-18

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分子信息与生态系统的进程相联系,可为人们提供了解系统脆弱性和评估生态系统健康情况的途径。美国橡树岭国家实验室发布了全球首个将杨树微生物组的分子信息与生态系统的进程相联系的数据集,将有助于科研人员观察基因组特征和分子水平事件与系统级属性及其环境影响之间的因果关系。相关研究成果于202445日发表在《科学数据》期刊上。

该数据集包含了与植物相关的微生物群落的环境和宏基因组信息、植物转录组学、植物和土壤代谢组学以及来源于模式树种杨树的土壤化学和活性特征测量数据。土壤、根际、根内和叶样本来自两种不同环境中生长的27种不同杨树基因型,从而形成一个由318个宏基因组、98个植物转录组和314个代谢组学谱组成的综合数据集。

据悉,该数据集在规模和范围上前所未有,完整的数据集包含的数据超过25TB,是美国国家微生物组数据协作项目(NMDC)的一部分。NMDC旨在支持微生物组与环境过程关联的数据共享。

信息来源:

https://www.sciencedaily.com/releases/2024/04/240408125933.htm

https://www.nature.com/articles/s41597-024-03069-7


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