2023年10月31日，DeepMind联合同构实验室（Isomorphic Labs）共同发布了新一代AlphaFold模型，有望改变药物发现的游戏规则。新一代AlphaFold可以预测蛋白质数据库（PDB）中几乎任何分子的结构，包括配体（小分子）、蛋白质、核酸（DNA和RNA）以及含有翻译后修饰（PTM）的生物分子，且通常具有原子精度。

研究人员指出，对于蛋白质-核酸界面，新一代AlphaFold优于RoseTTAFold2NA等同类模型，而对于RNA结构预测，它优于其他AI方法，但略微落后人类专家。在预测蛋白质-配体相互作用方面，新AlphaFold为蛋白质-配体结构预测设定了新的标准，其性能比传统方法高出约20%，并且还可预测尚未进行结构表征的全新蛋白质。

该模型的扩展功能和性能有助于加速生物医学的突破，并实现“数字生物学”的下一个时代，为疾病通路、基因组学、潜在治疗靶点、药物设计机制以及实现蛋白质工程和合成生物学的新平台的功能提供新的见解。

据悉，同构实验室正在将新一代AlphaFold模型应用于治疗药物设计，帮助快速准确地表征对治疗疾病很重要的多种类型的大分子结构。

信息来源：

https://www.isomorphiclabs.com/articles/a-glimpse-of-the-next-generation-of-alphafold

https://mp.weixin.qq.com/s/9AwitD_rfIEbflhm-AtV3A