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瑞士苏黎世联邦理工学院开发新算法揭示蛋白质进化秘密

日期:2023-10-31

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瑞士苏黎世联邦理工学院的科学家开发了名为“折叠搜索聚类”的新算法,可同时分析大量蛋白质结构,有助于科学家理解蛋白质的进化历程,并为人类免疫蛋白质的起源提供新见解。相关研究成果于2023913日发表在《自然》期刊上。

研究团队将该算法应用于阿尔法折叠数据库中2亿个已被预测的蛋白质结构,识别出了200多万个独特的结构聚类——一组在三维形状上彼此相似的蛋白质结构,其中1/3的聚类以前没有被描述或分类。

研究人员指出,了解蛋白质结构对于研究其功能和进化至关重要。折叠搜索聚类算法能以前所未有的规模对结构和集群进行比较,将完成此类任务的时间减少了几个数量级:使用现有方法对所有结构进行聚类需要10年,而使用折叠搜索聚类只需5天时间。

信息来源:

https://www.nature.com/articles/s41586-023-06510-w

http://digitalpaper.stdaily.com/http_www.kjrb.com/kjrb/html/2023-09/18/content_559692.htm?div=-1


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