美阿肯色大学开发出确定候选药物与蛋白质结合能力的计算机模型
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研究人员开发了一个理论框架来估测配体-蛋白质结合情况,该方法为配体在坐标系中的每个网格点都分配了一个有效能量,该能量的原点是配体处于结合状态时最可能的位置。研究人员使用偏差式模拟以及非参数重加权技术来考虑偏差,然后利用一种称为定向四元数形式主义的数学化技术,进一步描述配体与目标蛋白结合时的构象变化。
研究人员通过估计人成纤维细胞生长因子1(一种特殊的信号蛋白)与肝素六糖5(一种流行的药物)之间的结合亲和力来测试这种方法,结果表明,模拟和实验结果之间在性质上有很强的一致性。
信息来源:
https://techxplore.com/news/2023-01-drug-candidate-ability-proteins.html
https://www.nature.com/articles/s43588-022-00389-9