生命科学领域高性能计算的发展趋势
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二十年前,生命科学领域几乎没有高性能计算(HPC)的踪迹,现如今HPC已被用于生命科学和生物医学研究。基因组学和来自现代实验室仪器的数据调试是主要驱动因素,从长远来看其主要需求是进行预测性模拟以支持精准医学。2017年1月,生命科学计算咨询公司BioTeam副总裁兼总经理艾瑞 贝尔曼(Ari Berman)发文探讨了当今生命科学领域HPC应用不断变化的态势。Berman曾准确预测2015年约25%的生命科学家需要HPC资源的协助。到2017年年底,这个数字将上升到35%左右,到2018年底可能达到50%。Berman表示,科学家友好网关(如CyVerse,此前被称作iPlant)的出现能加速HPC在生命科学领域的应用。Berman提出了几大重要趋势,覆盖HPC应用的广泛趋势以及关键技术发展的特定趋势等。
(1)通过门户网站推广HPC应用
(2)基因组学数据处理不再是HPC的首要需求驱动
(3)生命科学核心计算趋势
(4)数据管理和存储挑战
(5)集群网络竞争激烈
(6)处理器的变革
来源:HPCwire网站