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中山医学院发布全球首个人类肢体发育单细胞时空图谱

日期:2024-03-07

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202417日据中山大学消息,该校中山医学院张宏波教授课题组发布了全球首个人类肢体发育单细胞时空图谱,解析了胎儿四肢的细胞演变路径和细胞空间位置决定过程。利用该图谱,能直观地追踪特定时间和区域产生的细胞类型,鉴定到全新的细胞类型,并可刻画不同种类细胞激活的关键基因。

肢体建成的时空调节机制是一个经典的发育生物学难题。在细胞命运决定这个问题上,科学家无法看到所有细胞的命运演化。而对于细胞的空间位置决定,科学家通过对胚胎做切片,了解到的基因数量十分有限。

单细胞转录组技术和单细胞空间转录组技术的发展,使得探秘细胞演化过程成为可能。研究团队从第五周初到第九周胚胎连续取样,获得超过10万个细胞,每个细胞约2000个基因,通过计算分析,研究团队率先构建起精细的、包含所有细胞类型的人类四肢发育单细胞图谱。

此外,研究团队还自主研发了单细胞数据分析工具——DEAPLOG,能更好地找到每一个细胞的特征,寻找到关键基因,并将这些基因锚定到细胞演变的路径上。在此基础上,研究团队科进一步通过实验验证哪些基因导致了细胞命运的歧化。

信息来源:

https://www.sciencedaily.com/releases/2023/12/231206115821.htm

http://digitalpaper.stdaily.com/http_www.kjrb.com/kjrb/html/2024-01/08/content_565386.htm?div=-1

https://www.nature.com/articles/s41586-023-06806-x


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