美加州大学首创串联重复扩增大规模遗传图谱
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人类基因组中存在着大量的串联重复(TR)序列,这些重复的DNA短片段与50多种致命的人类疾病有关。目前,全基因组测序捕获的串联重复扩增已被广泛用于罕见病的诊断。美国加州大学欧文分校针对多次重复的短长度DNA首次创建了串联重复扩增的遗传参考图谱(TR gnomeAD),利用TR gnomeAD可准确判断某些特征与不同人群和疾病之间的关系,解决了当前生物库基因组测序工作中一个关键难题。相关研究成果于2024年4月5日发表在《细胞》期刊上。
为了构建数据库,研究团队分析11个亚群的338963名参与者的基因组数据。在已识别的91万个TR中,86万个质量足够高,可供进一步研究。研究还发现,其中30.5%的人至少有两种常见的基因替代形式,这些基因是由位于染色体上同一位置的突变引起的。
研究人员表示,虽然已成功对大量TR进行了基因分型,但这仍只是人类基因组总数的一小部分。下一步,他们将优先考虑整合更多高质量的TR,并纳入更多代表性不足的血统。
信息来源:
https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(24)00252-6
http://digitalpaper.stdaily.com/http_www.kjrb.com/kjrb/html/2024-04/08/content_569721.htm?div=-1