人工智能赋能空间转录组数据的计算与解析研究获进展
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2023年10月12日,中国科学院数学与系统科学研究院张世华团队在《自然·计算科学》上发表了题为“整合不同条件、技术和发展阶段的空间转录组学数据”的研究论文。针对空间转录组测序数据在整合分析不同条件下产生的数据时存在的不可避免的批次效应,团队开发了针对来自不同技术、不同发育时间点、不同疾病条件的生物组织多切片空间转录组数据建立了整合分析新工具——STAligner。
上述研究将人工智能与空间转录组数据巧妙结合,为解析生物组织结构和细胞调控提供了颇有前景的系列工具STAGATE、STAligner、STAMarker。随着空间转录组技术的快速发展和数据的不断积累,这些工具将为大规模空间转录组数据的计算解析与生物挖掘提供支持。
信息来源:
https://www.cas.cn/zkyzs/2023/10/416/kyjz/202310/t20231024_4982308.shtml