新计算方法提升冷冻显微镜分辨率
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冷冻电子显微镜(cryo-EM)可以在分子水平实现病毒、蛋白质和其他生物结构的可视化,是促进生物化学知识形成的关键工具。美国劳伦斯 伯克利国家实验室研究人员开发的一种新算法进一步扩大了cryo-EM的作用和影响,该算法首次在构建噬菌体P22的三维原子尺度模型中起到了重要作用。该模型利用计算程序将来自贝勒医学院的2万多幅噬菌体P22的二维cryo-EM图像结合起来,形成了详细的三维结构模型。相关研究结果发表于2017年3月7日出版的《美国国家科学院院刊》(PNAS)。
该研究结果还可能具有宝贵的生物学意义。利用新构建的模型可以看到构成P22病毒各部分之间的相互作用,这些组成部分对于维持其稳定至关重要。这有助于研究人员弄清楚如何制备结合特定蛋白质的化学物质。此外,研究人员强调,对分子空间中原子配置的理解能力对提出药物设计和开发的新见解有所帮助。
来源:美国劳伦斯伯克利国家实验室