新软件精准快速识别和定位蛋白质
| 来源:科技日报 张佳欣【字号:大 中 小】
TomoTwin软件克服了许多现有工具的障碍:它学会在断层图像中挑选形状相似的分子,并将它们映射到几何空间。在学习过程中,它将相似的蛋白质放置在彼此附近的系统会得到奖励,否则会受到惩罚。
该软件为直接在细胞环境中自动识别和定位蛋白质铺平了道路,扩大了Cryo-ET的潜力。Cryo-ET有可能破译生物分子在细胞内的工作,并进一步揭示生命的基础和疾病的起源。
在TomoTwin软件生成的新图谱中,研究人员可分离并准确识别不同的蛋白质,利用这一点来定位它们在细胞内的位置。此外,该软件的一个优势是,通过取消训练步骤,甚至可在本地计算机上运行。
目前,该软件可在细胞中定位大于15万道尔顿的球状蛋白质或蛋白质复合体。未来,研究团队的目标是定位膜蛋白、丝状蛋白和较小尺寸的蛋白。